La capacitación es necesaria para comprender la operación y mantención un sistema de monitoreo continuo de emisiones. Existen diferentes niveles de capacitación, que se pueden dirigir para operadores de planta, técnicos y personal de administración. Los problemas de CEMS generalmente son más detectables y se monitorean más de cerca después de una capacitación; así como también las comunicaciones internas entre las operaciones de la planta y el personal de mantenimiento se logran definir mejor. Un personal capacitado se comunica mejor durante la resolución de problemas con el proveedor de CEMS durante los períodos de reparaciones y/o de emergencia. El programa de capacitación está diseñado para dirigirse a todo el personal de la planta que posea participación en el CEMS; El temario incluye una descripción general del CEMS, procedimientos de aseguramiento de la calidad, actividades limitadas de un QA / QC y reconocimiento de alarmas generales de CEMS.